Desde el mes de agosto del 2005 la carrera de Medicina de la Universidad Austral de Chile estaría inscrita en los registros para comenzar con el proceso de Acreditación MERCOSUR, según un comunicado de la Comisión Nacional de Acreditación de Pregrado (CNAP), perteneciente al Ministerio de Educación.
Este mecanismo considera la implementación experimental de la acreditación de carreras (MEXA) para el reconocimiento de grados académicos en los países miembros y asociados del Mercado Común del Sur (MERCOSUR).
Hasta el momento, Agronomía sería la única carrera de la Universidad Austral de Chile que integra este grupo.