Bajo el título “Bioinformatic analysis of Piscine orthoreovirus genetic reassortment: implications for Chilean salmon farming”, Laura Solarte, compartió los avances de su tesis de Doctorado en Congreso de Ciencias del Mar 2022, investigación enfocada al estudio del Piscine orthoreovirus (PRV) y cuyos primeros resultados indican que el virus en sus huéspedes chilenos ha experimentado diversificación genómica, lo cual representaría un riesgo para la industria salmonera nacional.
Según explicó la estudiante de la Escuela de Graduados de la Facultad de Ciencias UACh, el PRV es el responsable de generar inflamación del músculo esquelético y del corazón en especies acuícolas, observándose, solo para aquellas cultivadas en Chile, y principalmente en el salmón coho, la expresión de marcadores específicos de aminoácidos, los cuales podrían generar la evasión de una respuesta inmune en peces y aumentar su virulencia.
“Para investigar el potencial de reordenamiento en PRV, se alinearon doce aislamientos contra secuencias genómicas completas disponibles en bases de datos públicas y analizados filogenéticamente. Además, se detectaron eventos de reordenamiento en todo el genoma utilizando siete métodos estadísticos incluidos en el software RDP5”, precisó la estudiante.
En esta línea, agregó que los eventos de reordenamiento se detectaron con mayor frecuencia dentro de los genes L2, M1, M2, S1 y S2, que coincide con las incongruencias filogenéticas de los segmentos. Estos resultados ponen una alerta a las autoridades y a la industria salmonera, debido a posibles eventos de coinfección y transmisión lo que resulta en variaciones antigénicas y aumento de la virulencia.
«Los esfuerzos de vigilancia epidemiológica para comprender la diversidad genética y la evolución de PRV dentro de las fronteras chilenas debe continuar ayudando en el control y desarrollo de nuevas estrategias para evitar pérdidas en la industria del salmón», expresó la investigadora.
Cabe mencionar que el trabajo de tesis de Laura Solarte es patrocinado por el profesor Loncoman Carlos, del Laboratorio de Virología Molecular, Instituto de Bioquímica y Microbiología de la Facultad de Ciencias UACh.
Finalmente, destacar que el Congreso de Ciencias del Mar 2022 fue organizado por la Universidad Católica de la Santísima Concepción (UCSC) y la Sociedad Chilena de Ciencias del Mar (SCHCM). Tuvo lugar, en dependencias del Campus San Andrés de la UCSC entre los días 23 y 27 de mayo.
